IBM, Mayo-formuläret Open-source Health IT Consortium

Forskare inom biomedicinsk informatik hos IBM och Mayo Clinic har lanserat ett nytt open-source-konsortium med inriktning på behandling av naturligt språk (NLP), för att hjälpa läkare att dela diagnos och behandlingsinformation.

Public Health Consortium, som offentliggjordes, kommer att fokusera på teknik för att möjliggöra storskalig dataaggregering, så att läkare kan läka medicinska journaler i sina specialiteter för att hitta liknande fall att studera innan de gör svåra diagnoser eller innan de bestämmer behandlingen.

Läkare kommer att kunna granska läkarundersökningar om liknande fall, men ingen personligt identifierbar patientinformation kommer att finnas tillgänglig i databasen, säger IBM och Mayo.

Med lanseringen av konsortiet har de två organisationerna släppt två projekt under öppen källkod e licenser, en fokuserad på kliniska anteckningar och en om patologierapporter. Konsortiet använder Apache-licensen, version 2.0.

Organisationerna uppmanar andra att hjälpa till att utveckla NLP-verktyg. "Genom att göra det till ett open-source-initiativ hoppas vi kunna göra en bred användning av dessa NLP-verktyg, så att medicinska framsteg kan ske snabbare och effektivare", säger Christopher Chute, en bioinformatikexpert i Mayo Clinic och seniorkonsulent på projektet. ett uttalande.

Två andra hälso- och sjukvårdsorganisationer, Seattle Group Health och US Department of Veterans Affairs Boston Healthcare System, planerar att delta i konsortiet, och andra deltagare välkomnas, säger IBM och Mayo.

Som mer hälsa vårdgivare antar elektroniska journaler, kommer det att bli allt viktigare att kunna söka dessa poster, säger organisationerna. Mayo och IBM har utvecklat ett system för att extrahera information från mer än 25 miljoner textbaserade kliniska anteckningar baserat på IBMs ostrukturerad informationshanteringsarkitektur med öppen källkod, eller UIMA. De 9 organisationerna har också utvecklat ett system för att extrahera cancer-sjukdomskarakteristika från patologiska rapporter, vilket möjliggör beräkning av cancerfas.

"Storskalig informationsutvinning från den kliniska berättelsen är en viktig komponent för att främja translationell forskning och patientvård", Guergana Savova, en medicinsk informatikspecialist och Mayo leda på projektet, sade i ett uttalande. "Det låser upp" de kliniska textdata som finns i stora arkiv. En sådan teknik skulle möjliggöra storskalig datagruppering, analyser och användning - föreställ dig bara kraften i data från miljoner patienter. "

Organisationerna har inte men bestämde sig för vad NLP-projekt ska fungera på nästa, sade en talesman från IBM. "Målet är att först få feedback från deltagande institutioner på det ursprungliga projektet och expandera sedan," sa hon.