Car-tech

Foldproteiner, hjälpmedelssjukdomar i Foldit Videospel

Foldit: Biology for gamers - by Nature Video

Foldit: Biology for gamers - by Nature Video
Anonim

Låt det till videospelare hitta ett bättre sätt för shepherd-proteiner i sina optimala tredimensionella former.

Plying ett fritt tillgängligt spel och matchas mot automatiserade datortrutiner utformade för att fastställa hur aminosyror vrider sig i sina ideala former, vetenskapskalender Nature rapporterar videospelare tog toppbetyg, vika proteiner bättre än en dator.

Spelet heter Foldit (eller Fold.it) består av två års biokemi och datavetenskap vid University of Washington. Målet var enkelt: Kom på ett bättre och snabbare sätt att kasta proteiner genom att utnyttja hjärnkraften hos videospelare.

"Människor i det vetenskapliga samfundet har känt för Foldit ett tag och alla tyckte att det var en bra idé, "skrev UW associerad datavetenskap och ingenjörsprofessor Zoran Popovic i ett pressmeddelande. "Men den väldigt grundläggande frågan i de flesta forskarnas sinnen var" Vad kan det ge när det gäller resultat? Finns det några bevis för att det gör något användbart? "

" Jag hoppas att det här dokumentet kommer att övertyga många av de människor som var sitter i sidled, och hela genren av vetenskapliga upptäcktsspel kommer verkligen att ta av. "

Varför proteinvikning? Eftersom protein matar dina muskler och hjälper färjesignaler i din hjärna som styr din kropp, och eftersom felaktig vikning, som kan producera inaktiva eller felaktigt vikta proteiner, är associerat med allt från allergier till flera neurodegenerativa sjukdomar. Förstå hur proteiner borde vika hjälper forskare att förutse och rikta proteinstrukturer med Foldit, som fungerar lite som Tetris, ber spelare att faktiskt vika ett protein genom att skaka sidokedjor, vinkla ryggben och rensa lås och band. Och det visar sig att människor går väldigt bättre än datorer när man brister i problem som kräver riskupptagning och långsiktigt förutsägande - båda områdena är nödvändiga för att påskynda proteinvikning.

Enligt Foldits "om" -sida, "Antalet olika sätt även ett litet protein kan vikas är astronomiskt eftersom det finns så många grader av frihet. "

" Att bestämma vilken av de många, många möjliga strukturerna som är den bästa anses vara ett av de svåraste problemen i biologi idag och nuvarande metoderna tar mycket pengar och tid, även för datorer. Foldit försöker förutspå strukturen hos ett protein genom att utnyttja människors pussellösande intuitioner och få människor att spela konkurrenskraftigt för att lägga de bästa proteinerna. "

Kom ihåg SETI @ Hem? Jag brukade köra den appen natt och dag på mitt gamla skrivbord, men mindre - om jag är helt ärlig - att se om E.T. ringde än att beundra hur mycket snabbare min nya oavsett processor kunde pummelera University of California Berkeleys analytiska algoritmer.

Passiv "fåfänga" alien-scanning eller aktiv proteinavkodning för att hjälpa till att mildra eller faktiskt bota neurodegenerativa sjukdomar? Det är knappast ett val för spelare, är det.