Monika Westberg & Jonny Edvardsson, En skogsindustri i förändring
IBM har samarbetat med Roche, en tillverkare av medicintekniska produkter, för att bygga en billig enhet som kan läsa mänskliga genomer, meddelade företaget torsdagen. Även om tekniken fortfarande kan vara ett årtionde eller mer bort från kommersialiseringen, bör den, när den är färdig, ge alla läkare ett billigt och snabbt sätt av att undersöka patientens genomiska smink, säger Ajay Royyuru, chef för beräkningsbiologi vid IBM Research.
"Kostnaden för genom-sekvensering har kommit ner och hastigheten har börjat förbättras, men det finns fortfarande problem med hastighet, skala, genomströmning, liksom kostnad, "sade Royyuru.
Projektet kommer att använda IBMs" DNA Transistor ". Dessa transistorer innehåller nanoporer, eller mycket små porer, genom vilka en sträng av deoxiribonukleinsyra (DNA) kan köras. Nanopore identifierar varje bas av DNA genom att använda ett elektriskt fält. Eftersom nanopore delvis tillverkas av kisel, bör den kunna vara massproducerad av samma litografitekniker som används för att göra mikroprocessorer och därigenom hålla produktionen medan andra forskare också har undersökt användningen av nanoporer, kan sådana konstruktioner inte korrekt läsa DNA: n, eftersom DNAet färdas för snabbt genom porerna.
"Det är som att suga på spagetti. börjar gå igenom nanoporan, det går väldigt snabbt. Vi har sett 48 000 DNA-enheter gå igenom i 10 eller 20 millisekunder. Med den hastigheten har du väldigt liten chans att läsa det korrekt, säger Royyuru.
För att sakta ner DNA-hastigheten har IBM gjort på nanopore en elektrisk kontroll för att ratchet flödet till önskad hastighet. "Vi kan elektriskt styra DNA: s rörelse genom porerna. Vi kan avancera enheten efter enhet," sade han.
Även om DNA-sekvenseringstekniken har funnits sedan början av 1970-talet, avkodades inte hela mänskliga genomet i sin helhet fram till 2001, på grund av att automatiken behövde avkoda det stora antalet baspar som behöver läsas. Varje persons DNA innehåller cirka 3 miljarder baspar av nukleotider.
Medan DNA-sekvenseringstekniken har förbättrats sedan dess kostar det fortfarande några hundra tusen dollar för att läsa ett helt mänskligt genom, sade Royyuru. När den är klar ska den här enheten kunna göra jobbet var som helst från US $ 100 till $ 1.000 per läs, beräknades Royyuru.
Royyuru nekade att erbjuda en tid när maskinen skulle vara kommersiellt tillgänglig, med hänvisning till de många steg som behövs för att få några radikalt ny teknik till produktion. Han uppskattar att det tar ungefär fem till tio år att avsluta forskningen ensam.
Roches sekvenseringsdotterbolag, 454 Life Sciences, kommer till slut att marknadsföra de resulterande produkterna som kommer från detta samarbete. IBM kommer att föra partnerskapet sin expertis inom byggnadselektronik och datahantering, medan Roche kommer att tillämpa sin kunskap inom medicinsk diagnostik och genom sekvensering, säger Royyuru.
Att läsa en persons genetiska kod skulle kunna ha flera medicinska fördelar, förklarar Royyuru. Mest speciellt kommer det att tillåta läkare att "personifiera tillhandahållandet av sjukvård," sa han. Till exempel kommer många mediciner att fungera på vissa, men inte alla, människor. Att ha en persons DNA i handen kommer att hjälpa en läkare att ordinera lämplig medicin. Läsning av genomet kan också avslöja mottaglighet för vissa sjukdomar.
Kanske kan en annan tidig användning vara att bestämma hur lång tid individer kan leva. På torsdagen meddelade Boston University forskare att de har funnit vad som verkar vara genetiska signaturer av livslängd.
Joab Jackson täcker enterpise-programvara och generell teknikbrytande nyheter för
IDG News Service
. Följ Joab på Twitter på @Joab_Jackson. Joabs e-postadress är [email protected]
Gå med i PC-världsredaktörerna Ginny Mies, Tim Moynihan och Robert Strohmeyer i den korta men söta 31: e upplagan av PC World Podcast. Ginny ger oss några nyheter från utvecklarkonferensen i Google där hon gjorde en HTC Magic. Ginny rätter också om Palm Pre, som kommer att gå ut på 6 juni. En sak att se fram emot är dess webb-OS, så lyssna in för att ta reda på vilka typer av funktioner det kommer att ha. Hon säger också att den är perfekt för multi-tasking, men är Pres nya gränssnitt väldigt in
[Ytterligare läsning: De bästa Android-telefonerna för varje budget. ]
Efter ett par slumpmässiga rykten om att iOS 4.1 är överhängande, bekräftar ett stereotypiskt starkt svar som tydligen skickats från Steve Jobs att den höguppskattade iPhone-uppdateringen är , faktiskt "kommer snart". Detta kommer att bli den tredje uppdateringen till iOS 4 sedan dess första utgåva i juni, och om spekulation om iOS 4.1 är korrekt, kommer den här uppdateringen slutligen att vara den programvara som borde ha varit på iPhone 4 när den startades.
Jag är säker du är bekant med nu med den ökända antennproblemet som har plågat något segment av iPhone 4-befolkningen. Den ökända antennagaten orsakade en stor uppror - även om Steve Jobs och Apple har hävdat att dämpningen av signalkraften är helt normal, att endast en liten andel av iPhone 4-användare upplever problemet, och att om iPhone 4-användare skulle bara hålla smarttelefonen annorlunda problemet skulle lösas.
Kommer en systemåterställning att påverka eller ta bort mina personliga filer eller dokument? Vilka program eller drivrutiner kommer att påverkas efter att jag har genomfört en systemåterställning? Vilka ändringar kommer en systemåterställningseffekt att göra? Hur hittar jag det här? Några mycket vanliga frågor jag kommer att försöka svara här.
En systemåterställning påverkar dina systemfiler, program och registerinställningar. Det kan också göra ändringar i skript, batchfiler och andra typer av körbara filer på din Windows-dator. Så här ändras alla ändringar som gjorts till dessa filer.